Ela é baseada na individualidade bioquímica. Isso é bem lógico porque cada um tem uma reação metabólica diferente. Assim, um alimento que faz bem para um pode não fazer bem para outro. Isso vale para leite de vaca, farinha de trigo, açúcar ou mesmo brócolis, banana ou laranja. Há quem tenha reações alérgicas ou sinta dores de cabeça, incômodos intestinais, ansiedade, mudanças de humor. E as reações podem ocorrer dias após a ingestão. Por isso, antes de as pessoas comerem quantidades excessivas de determinados alimentos tidos como benéficos à saúde, é importante procurar a orientação de um nutricionista funcional, para saber se o alimento escolhido será bom para ela e se seu corpo poderá aproveitar todos os nutrientes oferecidos.

O nutricionista funcional identificará isso com: historia pessoal de patologias, de hábitos alimentares e de vida, historia familiar de morbidades/longevidade, polimorfismos genéticos, exposições tóxicas ocupacionais ou não; outros fatores: endotoxinas intestinais (produto das bactérias patogênicas, fungos e parasitas intestinais), exotoxinas (aditivos alimentares, poluentes, metais tóxicos, agrotóxicos, alergenos inalantes ou ingestante, desequilíbrios nutricionais)
Os processos fisiológicos fundamentais incluem a comunicação, tanto externa, quanto interna à célula, a transformação dos alimentos em energia, replicação, reparo e manutenção da integridade estrutural das células e de todo o organismo, eliminação de resíduos, proteção e defesa orgânica! Tratamento centrado ao paciente e não na doença, identificando e tratando causas e não sintomas, buscar equilíbrio nutricional evitando carências e excessos obtendo Saúde como objetivo principal!